近日,邢台市疾控中心经过样本制备、文库构建、序列测定和生物信息学分析等步骤,成功完成一份呼吸道样本的宏基因组测序工作,获取了样本中的全部微生物序列,同时经过序列比对、组装,获取了样本中肺炎链球菌等多种病原微生物的全基因组序列。
研究人员称,AI生成了自然界中已发现的“CRISPR-Cas家族”的4.8倍的蛋白质集群,完全实现了指数级扩展。 与CRISPRCasDB和CasPDB等精选数据库,以及世界上最大的蛋白质资源UniProt相比,最新创建的数据库显示出更大的多样性。
在迄今最广泛的基于CRISPR的基因编辑系统数据集上,研究者训练了LLM。这些LLM产生的蛋白质,将几乎所有天然存在的CRISPR-Cas家族的多样性,扩大了4.8倍!
在快速发展的基因工程领域中,CRISPR技术已成为精确基因编辑的关键工具。尽管前景诱人,但从gRNA选择到预测脱靶效应的CRISPR实验设计过程复杂,给初学者带来了巨大挑战。为了填补这一空白,研究团队推出了CRISPR-GPT,这是一种结合了大型语言 ...
① 美国康奈尔大学威尔康奈尔医学院郭春君团队揭示了肠道微生物如何通过代谢氨基酸影响宿主的营养平衡和生理功能;② 开发了一种基于代谢组学的高通量体外活体细菌检测方法,通过对104种肠道共生菌进行筛选,鉴定出能高效利用氨基酸的肠道微生物;③ ...
证券之星消息,根据企查查数据显示华大智造(688114)公布了一项国际专利申请,专利名为“参考序列的构建方法、宏基因组数据压缩方法和电子 ...
其中,基于宏基因组学的PMseq?病原微生物高通量基因检测根据不同病原类型(DNA或RNA病原体)以及不同的检测灵敏度,从血流感染、中枢神经系统 ...
【华大基因发布2023年年报:营收、净利双降,每10股派发现金股利1元】4月12日晚间,深圳华大基因股份有限公司(以下简称“华大基因”或“公司”)发布2023年年报。公告称,报告期内,公司营收、净利双降。公司2023年实现营业收入434,963.73 ...
哈佛大学生物与进化生物学 (OEB)在读博士Yunha Hwang与团队进行了一项开创性的研究,开发了一种能够破译基因组学复杂语言的人工智能系统gLM,可以从大量微生物数据中解码基因组学的复杂语言。这一创新使人们能够更深入地了解基因功能和调控,从而在基因组学方面取得新发现。gLM体现了人工智能在推进生命科学和应对全球挑战方面的潜力。研究结果发表在新一期的《Nature Communications ...
对于微塑料际的研究样本可以来自野外采集、野外样地实验和实验室微宇宙培养等。多组学研究方法可以帮助研究者在研究样本中群落组成以及总体群落和活跃群落的功能特征,更好地了解塑料际微生物群落的组装过程: ...
深圳新闻网2024年5月6日讯 (记者 林宏松 通讯员 黄海旋 薛丽珠 ...